46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0435 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  573  1.0000000000000001e-163  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  52.94 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1489  hypothetical protein  28.78 
 
 		 202 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.19 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  54.55 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  60.42 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  60 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  58.33 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.9 
 
 		 1141 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40.35 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  44 
 
 		 1151 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1346  hypothetical protein  35.21 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.427339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  42 
 
 		 1151 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  47.92 
 
 		 1503 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  47.17 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  44.9 
 
 		 1148 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  48 
 
 		 1149 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  40.82 
 
 		 1105 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.86 
 
 		 1291 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  28.97 
 
 		 406 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  46.67 
 
 		 1138 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  40.82 
 
 		 1139 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0586  hypothetical protein  46 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  47.83 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  40.74 
 
 		 1123 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  47.92 
 
 		 380 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  38.6 
 
 		 370 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  46 
 
 		 110 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  41.18 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.78 
 
 		 1080 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2408  hypothetical protein  28.8 
 
 		 178 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 		 680 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  30.88 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2825  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  42.22 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0982  putative transcriptional regulator, CopG family  33.85 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.01357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  43.14 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.73 
 
 		 1081 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1103  hypothetical protein  39.58 
 
 		 408 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  37.31 
 
 		 433 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  30.56 
 
 		 383 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  42 
 
 		 100 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  42 
 
 		 100 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.298967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>