20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2408 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2408  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  359  1e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0167  hypothetical protein  59.9 
 
 
197 aa  206  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0525  hypothetical protein  52.28 
 
 
198 aa  179  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.497399  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2825  hypothetical protein  47.78 
 
 
204 aa  169  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0982  putative transcriptional regulator, CopG family  42.45 
 
 
246 aa  159  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.01357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  36 
 
 
110 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1894  type II secretion system protein E  40.82 
 
 
317 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  36 
 
 
380 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  39.62 
 
 
325 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  29.2 
 
 
397 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  26.09 
 
 
376 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.13 
 
 
1080 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  40.38 
 
 
370 aa  45.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  38.78 
 
 
806 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  36.54 
 
 
351 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  29.58 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  38.78 
 
 
823 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  35.82 
 
 
288 aa  42.4  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  39.62 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  38.46 
 
 
406 aa  41.6  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>