118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0469 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  830    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.93 
 
 
356 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.21 
 
 
360 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  34.72 
 
 
358 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  30.17 
 
 
433 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  30.05 
 
 
370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  31.11 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  33.24 
 
 
353 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.95 
 
 
388 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  36.63 
 
 
363 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.94 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  25.77 
 
 
351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  31.98 
 
 
385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  32.14 
 
 
371 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  31.64 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  31.37 
 
 
387 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  31.91 
 
 
340 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.98 
 
 
375 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  31.32 
 
 
369 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  31.32 
 
 
369 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.96 
 
 
369 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.45 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  25.19 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  29.75 
 
 
337 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  26.99 
 
 
325 aa  113  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  31.1 
 
 
376 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  29.15 
 
 
369 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  29.18 
 
 
353 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  28.78 
 
 
349 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  29.84 
 
 
376 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  28.51 
 
 
360 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  29.18 
 
 
371 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  32.17 
 
 
396 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  26.95 
 
 
342 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  27.99 
 
 
355 aa  103  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  27.86 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  27.14 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  27.46 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  27.45 
 
 
346 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  26.86 
 
 
349 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  26.86 
 
 
349 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  27.06 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  28.52 
 
 
356 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  27.06 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  28.52 
 
 
353 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  26.03 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  26.86 
 
 
350 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  26.87 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  24.42 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  25.49 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  26 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  26.13 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  25.42 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  25.14 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  24.07 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  23.84 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  25.61 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  64 
 
 
131 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1477  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  52.94 
 
 
214 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  48.98 
 
 
110 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.89 
 
 
1149 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  29.75 
 
 
505 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0586  hypothetical protein  46.94 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 
1151 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  46.15 
 
 
406 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  46.94 
 
 
1139 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.14 
 
 
1141 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6771  hypothetical protein  40 
 
 
457 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 
1148 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  52.08 
 
 
101 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  37.29 
 
 
288 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0335  hypothetical protein  46.81 
 
 
76 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  39.62 
 
 
1151 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  36.92 
 
 
123 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  38.67 
 
 
121 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  49.02 
 
 
237 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  38.16 
 
 
127 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  37.84 
 
 
127 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  38.16 
 
 
127 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  42.62 
 
 
158 aa  51.2  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2769  FHA domain-containing protein  27.13 
 
 
526 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  41.18 
 
 
157 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  28.07 
 
 
514 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0667  hypothetical protein  38.6 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.747823  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  41.67 
 
 
1153 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  26.47 
 
 
383 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  43.75 
 
 
91 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  38.57 
 
 
123 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1346  hypothetical protein  36.67 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.427339  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2048  hypothetical protein  31 
 
 
265 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.113885  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  42.86 
 
 
1503 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.22 
 
 
1080 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3332  hypothetical protein  38.46 
 
 
137 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1562  hypothetical protein  38.46 
 
 
137 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3945  hypothetical protein  38.46 
 
 
132 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3039  hypothetical protein  38.46 
 
 
137 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0148  hypothetical protein  38.46 
 
 
137 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608711  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4018  hypothetical protein  38.46 
 
 
137 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  45.83 
 
 
1291 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>