64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4677 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  100 
 
 
317 aa  649    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  60.88 
 
 
315 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  44.63 
 
 
363 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  43.45 
 
 
371 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  44.76 
 
 
387 aa  232  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  37.5 
 
 
344 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  41.27 
 
 
376 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  44.21 
 
 
368 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  37.2 
 
 
340 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  39.92 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  41.32 
 
 
369 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.32 
 
 
369 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  41.32 
 
 
369 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  41.13 
 
 
360 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  36.45 
 
 
343 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  34.55 
 
 
337 aa  218  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  36.26 
 
 
349 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  40.5 
 
 
376 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  35.59 
 
 
349 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  35.59 
 
 
349 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  35.06 
 
 
355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  36.13 
 
 
353 aa  212  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.42 
 
 
388 aa  208  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  39.84 
 
 
369 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  39.43 
 
 
342 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  35.55 
 
 
371 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  38.33 
 
 
396 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
346 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  33.83 
 
 
346 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  33.53 
 
 
346 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  33.53 
 
 
346 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  38.02 
 
 
353 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  38.02 
 
 
356 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  37.19 
 
 
350 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.34 
 
 
375 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.41 
 
 
356 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.58 
 
 
360 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  31.6 
 
 
380 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  32.39 
 
 
353 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  31.58 
 
 
358 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  34.18 
 
 
376 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  33.94 
 
 
370 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  33.33 
 
 
433 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  30.57 
 
 
351 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  25.62 
 
 
330 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  26.1 
 
 
334 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  26.64 
 
 
380 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  27.5 
 
 
406 aa  79.3  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  23.88 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  25.68 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  20.76 
 
 
385 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  24.88 
 
 
406 aa  59.3  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  28.5 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  28.5 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  28.86 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  25.23 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  28.08 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  23.42 
 
 
370 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  29.31 
 
 
397 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  27.5 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  21.58 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  26.36 
 
 
387 aa  46.2  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2318  hypothetical protein  25.51 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2106  hypothetical protein  20.73 
 
 
379 aa  42.7  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0725633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>