30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26070 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  100 
 
 		 370 aa  756    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  58.61 
 
 		 387 aa  457  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  46.07 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2106  hypothetical protein  31.87 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0725633 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0869  hypothetical protein  30.35 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1615  hypothetical protein  32.72 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  30.89 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06420  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  26.81 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  30.82 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.7 
 
 		 397 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  28.3 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.42 
 
 		 317 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03651  hypothetical protein  40 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  21.86 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  24.38 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  22.13 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  20.87 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  23.11 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.35 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  22.33 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  22.33 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3624  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00015397  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1036  hypothetical protein  55.17 
 
 		 188 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.64 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  22.58 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  21.81 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  22.39 
 
 		 369 aa  43.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  22.33 
 
 		 396 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  25.62 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  25.66 
 
 		 369 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>