58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1369 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  100 
 
 
342 aa  705    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  64.31 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  62.5 
 
 
343 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  62.55 
 
 
344 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  63.73 
 
 
349 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  63.73 
 
 
349 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  64.16 
 
 
340 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  58.5 
 
 
355 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  57.95 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  58.28 
 
 
371 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  60.47 
 
 
350 aa  350  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  60.07 
 
 
353 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  60.07 
 
 
356 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  60.08 
 
 
346 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  59.69 
 
 
346 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  59.69 
 
 
346 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  57.82 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  56.66 
 
 
349 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  45.74 
 
 
369 aa  255  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  45.63 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  45.63 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  45.36 
 
 
363 aa  252  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  45.35 
 
 
368 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  44.44 
 
 
369 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  43.63 
 
 
376 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.52 
 
 
370 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  42.37 
 
 
376 aa  242  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.25 
 
 
388 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  40.62 
 
 
371 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  43.72 
 
 
396 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  40.91 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  36.26 
 
 
358 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  38.44 
 
 
353 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  38.41 
 
 
360 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.91 
 
 
356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40.08 
 
 
315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  39.43 
 
 
317 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.91 
 
 
360 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.61 
 
 
375 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  36.79 
 
 
380 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  29 
 
 
376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  26.59 
 
 
370 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  26.35 
 
 
380 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  28.65 
 
 
433 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  25.22 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  27.94 
 
 
406 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  23.74 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  25.49 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  27.35 
 
 
325 aa  99  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  24.3 
 
 
397 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  25.95 
 
 
330 aa  87  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  25.76 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  26.06 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  25.3 
 
 
401 aa  79.3  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  25.81 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  25.51 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  23.87 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  22.4 
 
 
291 aa  42.7  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>