70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0818 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  100 
 
 		 350 aa  700    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  88.67 
 
 		 353 aa  564  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  87.92 
 
 		 356 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  91.14 
 
 		 346 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  90.86 
 
 		 346 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  90.86 
 
 		 346 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  65.23 
 
 		 344 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  66.09 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  60.46 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  55.87 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  60.74 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  60.74 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  53.82 
 
 		 349 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  52.54 
 
 		 355 aa  348  8e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  51.4 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  60.47 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  51.4 
 
 		 371 aa  344  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  53.39 
 
 		 346 aa  339  5e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  45.63 
 
 		 369 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  45.63 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  45.63 
 
 		 369 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  42.86 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  44.62 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40.57 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.98 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  44.79 
 
 		 376 aa  252  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  44.07 
 
 		 396 aa  249  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  44.17 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  40.91 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  37.68 
 
 		 371 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.21 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.73 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  37.2 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.69 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.31 
 
 		 388 aa  202  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  36.59 
 
 		 380 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  35.76 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  33.55 
 
 		 353 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  30.85 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.08 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.26 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  29.88 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  28.68 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  23.58 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  26.18 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  24.41 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  24.1 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  26.86 
 
 		 406 aa  92.8  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  29.01 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  27.41 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  29.9 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  31.82 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  29.9 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  28.44 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  28.64 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  24.81 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.17 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  21.08 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  24.3 
 
 		 385 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03651  hypothetical protein  51.79 
 
 		 203 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  24.24 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  23.23 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  25.51 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  23.23 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0413  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  26.37 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  26.53 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  41.38 
 
 		 287 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  25.51 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  48.08 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>