More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1100 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  100 
 
 
304 aa  615  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  95.72 
 
 
304 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  87.17 
 
 
305 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  87.17 
 
 
305 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  87.17 
 
 
305 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  87.17 
 
 
305 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  87.83 
 
 
304 aa  548  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  86.84 
 
 
305 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  87.09 
 
 
305 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  87.09 
 
 
305 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  86.75 
 
 
305 aa  541  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  87.09 
 
 
305 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  87.09 
 
 
305 aa  542  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  87.09 
 
 
305 aa  542  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  87.09 
 
 
305 aa  542  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  87.09 
 
 
305 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  87.09 
 
 
305 aa  542  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  90.13 
 
 
304 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  90.13 
 
 
304 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  90.13 
 
 
304 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  87.29 
 
 
301 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  88.16 
 
 
304 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  86.51 
 
 
307 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  81.98 
 
 
300 aa  462  1e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  80.28 
 
 
306 aa  460  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  72.09 
 
 
306 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  73.33 
 
 
304 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  75.27 
 
 
307 aa  428  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  72.88 
 
 
305 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  66.79 
 
 
332 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  65.77 
 
 
304 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  67.14 
 
 
346 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  66.07 
 
 
345 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  70.89 
 
 
311 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  62.33 
 
 
319 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.16 
 
 
309 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  61.56 
 
 
344 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  64.29 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.75 
 
 
328 aa  394  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  63.57 
 
 
329 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  61.94 
 
 
336 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  63.57 
 
 
331 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.39 
 
 
328 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  64.52 
 
 
329 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.71 
 
 
334 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.9 
 
 
305 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  62.54 
 
 
321 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  62.37 
 
 
334 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  59.25 
 
 
326 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  61.59 
 
 
332 aa  371  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  64.24 
 
 
304 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  55.07 
 
 
318 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  60.98 
 
 
326 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  55.07 
 
 
318 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.93 
 
 
319 aa  358  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  58.59 
 
 
312 aa  352  2.9999999999999997e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  60 
 
 
319 aa  345  7e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  46.56 
 
 
310 aa  262  6e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  40.99 
 
 
356 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  41.42 
 
 
327 aa  256  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  44.41 
 
 
304 aa  251  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  40.33 
 
 
326 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  38.96 
 
 
326 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  40.58 
 
 
305 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  40.58 
 
 
305 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  40.85 
 
 
369 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.33 
 
 
316 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.33 
 
 
316 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  40.85 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  42.24 
 
 
284 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  41.56 
 
 
311 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  43.4 
 
 
394 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  41.73 
 
 
284 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  41.97 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.37 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  41.37 
 
 
284 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  40.07 
 
 
311 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  40.07 
 
 
311 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  43.22 
 
 
304 aa  233  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.37 
 
 
284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  44.21 
 
 
439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.76 
 
 
359 aa  232  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  42.81 
 
 
398 aa  232  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  43.01 
 
 
429 aa  231  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  42.56 
 
 
403 aa  231  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  40.39 
 
 
322 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  41.04 
 
 
322 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.65 
 
 
322 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.73 
 
 
318 aa  229  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.72 
 
 
321 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  40.72 
 
 
321 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.72 
 
 
321 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  40.72 
 
 
322 aa  228  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  40.72 
 
 
322 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  41.13 
 
 
406 aa  228  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  40.46 
 
 
308 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  40.07 
 
 
322 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  40.41 
 
 
327 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  41.3 
 
 
345 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  41.75 
 
 
356 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>