More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4303 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  70.21 
 
 		 305 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  70.21 
 
 		 305 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  70.21 
 
 		 305 aa  425  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  70.55 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  70.55 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  70.21 
 
 		 305 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  70.55 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.52 
 
 		 304 aa  424  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  70.21 
 
 		 305 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  70.21 
 
 		 305 aa  425  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  70.21 
 
 		 305 aa  425  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  70.55 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  70.21 
 
 		 305 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  70.55 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.86 
 
 		 305 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  68.62 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.4 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  70.65 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  70.89 
 
 		 304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  67.01 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  69.05 
 
 		 301 aa  401  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  69.04 
 
 		 328 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  68.44 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  69.18 
 
 		 304 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  70.92 
 
 		 307 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  69.18 
 
 		 304 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  63.55 
 
 		 304 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  69.18 
 
 		 304 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  66.67 
 
 		 345 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.17 
 
 		 309 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  70.71 
 
 		 304 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  63.33 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  68.28 
 
 		 305 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  62.85 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  63.03 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  67.47 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  59.34 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.68 
 
 		 305 aa  384  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  61.49 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  65.75 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  66.78 
 
 		 306 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  64.51 
 
 		 319 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  69.78 
 
 		 300 aa  384  1e-105  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.89 
 
 		 306 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.51 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  60.53 
 
 		 332 aa  367  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  63.35 
 
 		 321 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.49 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  61.03 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  58.01 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  64.62 
 
 		 304 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  56.67 
 
 		 318 aa  355  5.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  56.67 
 
 		 318 aa  355  5.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  56.96 
 
 		 326 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  58.59 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.39 
 
 		 312 aa  335  3.9999999999999995e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  39.69 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  40.06 
 
 		 356 aa  249  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  44.68 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  45.79 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  40.13 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  40.91 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  40.91 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  41.1 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  40.65 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  42.36 
 
 		 345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  41.78 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.6 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  42.59 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  42.71 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  41.22 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  41.22 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  40.07 
 
 		 406 aa  228  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.34 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  39.02 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  41.98 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  42.61 
 
 		 429 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  39.07 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  40.61 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.49 
 
 		 376 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  41.18 
 
 		 398 aa  222  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  42.4 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  39.24 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  41.64 
 
 		 361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  40.78 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  41.97 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.74 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.74 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.87 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  39.74 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.74 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.74 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  39.58 
 
 		 284 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.74 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.56 
 
 		 328 aa  218  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.96 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  39.48 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  39.48 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>