90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2485 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  835    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  57.35 
 
 		 403 aa  495  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  57 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  33.57 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  33.23 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  30.86 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0869  hypothetical protein  31.91 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1615  hypothetical protein  33.04 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2106  hypothetical protein  30.38 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0725633 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06420  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  31.4 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224562  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  33.33 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  26.2 
 
 		 356 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  26.97 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  25.53 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  25.27 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  25.75 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  25.68 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  24.71 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  26.61 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  25.68 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  27.27 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  23.02 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  26.04 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  21.43 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  26.83 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  25.51 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  23.98 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  24.9 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  23.25 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  24.71 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  25.2 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  24.71 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.85 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  24.9 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  25.22 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  24.67 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  23.05 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  23.01 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  24.49 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  24.49 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  21.38 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  24.36 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  23.01 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  22.89 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  25.19 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.3 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  21.91 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  21.97 
 
 		 353 aa  57  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  24 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  22.91 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  21.97 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  24 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  27.64 
 
 		 315 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  51.02 
 
 		 110 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  51.02 
 
 		 1149 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  20.18 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  20.42 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  52.27 
 
 		 237 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1521  FHA domain-containing protein  44 
 
 		 295 aa  50.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111872  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  21.97 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  21.52 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  25.1 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  36.25 
 
 		 121 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  21.52 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  44 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4216  FHA domain-containing protein  42 
 
 		 287 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000473857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  45.83 
 
 		 127 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  45.83 
 
 		 127 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  21.52 
 
 		 350 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  36.71 
 
 		 127 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0687  hypothetical protein  46.15 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1456  FHA domain containing protein  40 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  46.94 
 
 		 214 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5893  hypothetical protein  50 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1482  FHA domain containing protein  40 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.30072  normal  0.365502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5037  FHA domain containing protein  40 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  37.14 
 
 		 123 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  38.33 
 
 		 123 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2048  hypothetical protein  44.26 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.113885  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  40.82 
 
 		 1148 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1699  DNA polymerase II large subunit  34.92 
 
 		 1141 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.672511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  38.78 
 
 		 1093 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6771  hypothetical protein  41.82 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  44.9 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  35.94 
 
 		 514 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.86 
 
 		 1141 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  46.67 
 
 		 1138 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  37.1 
 
 		 505 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  38.78 
 
 		 1151 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>