37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0139 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  233  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  75.2 
 
 
123 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  80.31 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  80.31 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  78.86 
 
 
121 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  72.87 
 
 
127 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3039  hypothetical protein  57.63 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1562  hypothetical protein  57.63 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3332  hypothetical protein  57.63 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3945  hypothetical protein  57.63 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0148  hypothetical protein  57.63 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608711  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4018  hypothetical protein  57.63 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3289  hypothetical protein  53.57 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  52 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  40 
 
 
380 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  43.75 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  42.31 
 
 
406 aa  45.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  47.92 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
624 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  47.92 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  52.08 
 
 
353 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  28.71 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  40.91 
 
 
358 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  51.06 
 
 
1093 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  40.82 
 
 
340 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  47.06 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  41.18 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  40 
 
 
1503 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  43.48 
 
 
360 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0335  hypothetical protein  53.33 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  40.43 
 
 
330 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  38.89 
 
 
370 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  32.69 
 
 
433 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  40.38 
 
 
325 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3957  hypothetical protein  41.67 
 
 
421 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  36.17 
 
 
669 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  36.17 
 
 
669 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>