63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5969 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  197  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  197  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  60 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  48.08 
 
 		 340 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  52.08 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  50.88 
 
 		 353 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  50 
 
 		 323 aa  54.3  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  47.92 
 
 		 323 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  37 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  51.02 
 
 		 356 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  46.81 
 
 		 1139 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  48.98 
 
 		 360 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  39.02 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  40.58 
 
 		 406 aa  50.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  37.74 
 
 		 380 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 680 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  45.28 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0026  putative protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 651 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  43.28 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  48 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  43.48 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.82 
 
 		 1141 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.67 
 
 		 1149 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.78 
 
 		 1291 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4022  protein serine/threonine phosphatase  37.78 
 
 		 642 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  42.55 
 
 		 1151 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  44.44 
 
 		 1093 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  42.59 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  46 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  46 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0619  putative protein serine/threonine phosphatase  37.78 
 
 		 733 aa  43.9  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163625  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06650  hypothetical protein  42.5 
 
 		 402 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40.82 
 
 		 388 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  42.55 
 
 		 325 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  41.3 
 
 		 1138 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  42 
 
 		 288 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  40.43 
 
 		 1151 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4395  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3289  hypothetical protein  39.06 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  40.43 
 
 		 1148 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  37.25 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  35.56 
 
 		 669 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0335  hypothetical protein  45.65 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  36.51 
 
 		 433 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2765  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40 
 
 		 419 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  35.56 
 
 		 669 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2391  protein serine/threonine phosphatase  42 
 
 		 422 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6771  hypothetical protein  38.46 
 
 		 457 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  38.3 
 
 		 1105 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  36.17 
 
 		 624 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1503 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3332  hypothetical protein  42.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  38.89 
 
 		 237 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3039  hypothetical protein  42.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1562  hypothetical protein  42.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  41.82 
 
 		 358 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0148  hypothetical protein  42.55 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608711  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4018  hypothetical protein  42.55 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3945  hypothetical protein  42.55 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0474  hypothetical protein  46.43 
 
 		 239 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.21 
 
 		 397 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  40.35 
 
 		 370 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>