70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3475 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  196  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  46.81 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  56.25 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  54.55 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  54.55 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4395  hypothetical protein  40.43 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 		 1151 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  51.06 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  40.82 
 
 		 1151 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  47.92 
 
 		 330 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  46.81 
 
 		 1139 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  43.55 
 
 		 514 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  42.55 
 
 		 1148 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  40.82 
 
 		 624 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  45.83 
 
 		 323 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  43.14 
 
 		 380 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  53.19 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.68 
 
 		 1149 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  45.83 
 
 		 323 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  42.55 
 
 		 680 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4022  protein serine/threonine phosphatase  42.55 
 
 		 642 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0619  putative protein serine/threonine phosphatase  42.55 
 
 		 733 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163625  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  51.02 
 
 		 406 aa  51.2  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42 
 
 		 388 aa  50.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  45.65 
 
 		 1138 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.22 
 
 		 1141 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.78 
 
 		 1291 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0335  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0026  putative protein serine/threonine phosphatase  38.3 
 
 		 651 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  40.32 
 
 		 376 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  52.08 
 
 		 340 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  38.89 
 
 		 351 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  43.75 
 
 		 370 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  38.55 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  44.23 
 
 		 214 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 		 669 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 		 669 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  44.93 
 
 		 353 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 1123 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06650  hypothetical protein  31.94 
 
 		 402 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2769  FHA domain-containing protein  37.68 
 
 		 526 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  39.68 
 
 		 505 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  45.9 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3289  hypothetical protein  44 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1562  hypothetical protein  47.92 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3332  hypothetical protein  47.92 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3039  hypothetical protein  47.92 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3945  hypothetical protein  47.92 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  38.78 
 
 		 1093 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0148  hypothetical protein  47.92 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608711  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4216  FHA domain-containing protein  47.92 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000473857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4018  hypothetical protein  47.92 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  45.1 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0271  FHA domain containing protein  33.8 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.373949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.78 
 
 		 1081 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  48 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  48 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  42.86 
 
 		 433 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0534  FHA domain-containing protein  45.83 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.895952  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2434  FHA domain-containing protein  34.85 
 
 		 284 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0872027  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1346  hypothetical protein  37.04 
 
 		 352 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.427339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3047  FHA domain-containing protein  34.85 
 
 		 275 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.73 
 
 		 1080 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  45.1 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1521  FHA domain-containing protein  45.83 
 
 		 295 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  38.78 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.22 
 
 		 397 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  35.71 
 
 		 383 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5037  FHA domain containing protein  43.75 
 
 		 235 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>