50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1720 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  189  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4395  hypothetical protein  39 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  56 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  44.23 
 
 		 370 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  48.94 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  39.39 
 
 		 380 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  48.94 
 
 		 388 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  45.83 
 
 		 360 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  45.1 
 
 		 353 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  43.75 
 
 		 406 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  38.33 
 
 		 514 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3332  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1562  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3039  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  43.48 
 
 		 121 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.91 
 
 		 1141 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  46.15 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3945  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4018  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  36.07 
 
 		 505 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  40.82 
 
 		 624 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0148  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2769  FHA domain-containing protein  34.33 
 
 		 526 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  47.83 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  42.86 
 
 		 358 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  40.38 
 
 		 376 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.91 
 
 		 1149 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  40.91 
 
 		 1139 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  46.81 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  40.43 
 
 		 340 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3289  hypothetical protein  40.62 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.13 
 
 		 1291 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  40.43 
 
 		 330 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  29.21 
 
 		 403 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  37.25 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  39.68 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  41.18 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  41.18 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  38.64 
 
 		 1148 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  38.64 
 
 		 1151 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  38.89 
 
 		 433 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2551  FHA domain-containing protein  32.91 
 
 		 418 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  38.3 
 
 		 323 aa  41.2  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  37.78 
 
 		 680 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  43.4 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  43.4 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  38.64 
 
 		 1151 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  38.3 
 
 		 323 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0687  hypothetical protein  36.54 
 
 		 502 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1295  FHA domain containing protein  40.68 
 
 		 295 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>