32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4395 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4395  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  184  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  39 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  46 
 
 		 358 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.46 
 
 		 388 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06650  hypothetical protein  33.8 
 
 		 402 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  41.82 
 
 		 353 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38 
 
 		 1291 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  42.55 
 
 		 1093 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  39.22 
 
 		 406 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2048  hypothetical protein  36.84 
 
 		 265 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.113885  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6771  hypothetical protein  38.46 
 
 		 457 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  45.65 
 
 		 899 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  28.57 
 
 		 433 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  30.61 
 
 		 380 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  38.78 
 
 		 370 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3957  hypothetical protein  37.5 
 
 		 421 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  36.36 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 		 1151 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  38.18 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 		 1151 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  35.42 
 
 		 1148 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  36.54 
 
 		 340 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  41.67 
 
 		 214 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1346  hypothetical protein  34.55 
 
 		 352 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.427339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  36.07 
 
 		 514 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1477  hypothetical protein  29.67 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  38 
 
 		 323 aa  40.8  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  38 
 
 		 323 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.69 
 
 		 360 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  39.58 
 
 		 1123 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0680  hypothetical protein  27.59 
 
 		 310 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>