24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1346 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1346  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  691    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.427339  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1125  hypothetical protein  42.36 
 
 
209 aa  86.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2287  hypothetical protein  38.95 
 
 
115 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  35.21 
 
 
288 aa  56.2  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  50 
 
 
383 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.48 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  44.29 
 
 
1148 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  36.67 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  41.07 
 
 
214 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1477  hypothetical protein  38.1 
 
 
155 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  37.04 
 
 
514 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  32.14 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  35.71 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5367  membrane protein with C2C2 zinc finger  26.12 
 
 
516 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  41.07 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0667  hypothetical protein  40 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.747823  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  40.58 
 
 
1151 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40.74 
 
 
360 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  37.1 
 
 
385 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2048  hypothetical protein  32.79 
 
 
265 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.113885  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  37.04 
 
 
101 aa  43.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  34.48 
 
 
376 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  26.92 
 
 
370 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>