46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2185 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  437  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  44.44 
 
 
237 aa  184  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5893  hypothetical protein  35.71 
 
 
221 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  52.94 
 
 
406 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  57.45 
 
 
360 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  53.19 
 
 
356 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  52.08 
 
 
388 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  40.82 
 
 
376 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.65 
 
 
1141 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  34.26 
 
 
383 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.48 
 
 
1149 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  53.19 
 
 
131 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  47.83 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  43.48 
 
 
1139 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0586  hypothetical protein  24.5 
 
 
299 aa  49.3  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1346  hypothetical protein  41.07 
 
 
352 aa  48.5  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.427339  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  45.83 
 
 
101 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  39.22 
 
 
325 aa  46.6  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  45.65 
 
 
1105 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  39.06 
 
 
351 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  41.07 
 
 
370 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1477  hypothetical protein  31.71 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  42.86 
 
 
110 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  46.94 
 
 
406 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 
1151 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  40 
 
 
358 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  45 
 
 
397 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 
1151 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  41.3 
 
 
1148 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  36 
 
 
1503 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  43.48 
 
 
1291 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2048  hypothetical protein  37.93 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.113885  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06650  hypothetical protein  37.1 
 
 
402 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735412  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
505 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  42.22 
 
 
1138 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  39.13 
 
 
680 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  40 
 
 
380 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  39.58 
 
 
353 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0335  hypothetical protein  40.43 
 
 
76 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  37.25 
 
 
91 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0769  hypothetical protein  38.46 
 
 
351 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4395  hypothetical protein  41.67 
 
 
93 aa  42  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2769  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
526 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  46 
 
 
433 aa  41.6  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5037  FHA domain containing protein  38.78 
 
 
235 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  42.86 
 
 
340 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>