24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5893 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5893  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  35.71 
 
 
214 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  27.87 
 
 
237 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  51.06 
 
 
1089 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  53.19 
 
 
388 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0687  hypothetical protein  45 
 
 
502 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  52.08 
 
 
406 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  43.14 
 
 
1503 aa  47  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  50 
 
 
406 aa  45.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  46.81 
 
 
1149 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  46.94 
 
 
380 aa  45.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  55.26 
 
 
353 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.55 
 
 
1081 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.55 
 
 
1080 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  52.63 
 
 
358 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3289  hypothetical protein  40.58 
 
 
138 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  46.81 
 
 
158 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3945  hypothetical protein  41.18 
 
 
132 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  46.81 
 
 
1291 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4018  hypothetical protein  41.18 
 
 
137 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0148  hypothetical protein  41.18 
 
 
137 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608711  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3332  hypothetical protein  41.18 
 
 
137 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1562  hypothetical protein  41.18 
 
 
137 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3039  hypothetical protein  41.18 
 
 
137 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>