91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1083 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  725    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  84.94 
 
 		 353 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  51.87 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  48.42 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.33 
 
 		 356 aa  289  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.06 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  46.93 
 
 		 370 aa  245  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  43.32 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  43.95 
 
 		 363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.81 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40.32 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.74 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  41.43 
 
 		 376 aa  206  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.46 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  40.78 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  42.39 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  42.39 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  38.75 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  38.55 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 371 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  43.8 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  39.41 
 
 		 344 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  39.6 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  31.58 
 
 		 351 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  37.04 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  34.9 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  35.4 
 
 		 380 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  35.64 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.01 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  34.12 
 
 		 371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  32.43 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  36.8 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  37.2 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  37.2 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  33.68 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  35.89 
 
 		 346 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  34.69 
 
 		 346 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  35.48 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  35.89 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  35.48 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  35.89 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.58 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  30.49 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  33.81 
 
 		 325 aa  159  8e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  35.08 
 
 		 350 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  28.03 
 
 		 380 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  27.81 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  29.67 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  28.77 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  28.2 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  27.75 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  27.91 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  27.65 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  25.46 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.89 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  21.57 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  52.17 
 
 		 131 aa  52.8  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4395  hypothetical protein  46 
 
 		 93 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  21.81 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  23.63 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5037  hypothetical protein  34.25 
 
 		 162 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  42.62 
 
 		 123 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  42.25 
 
 		 127 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  38.16 
 
 		 123 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  31.82 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  41.94 
 
 		 121 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5094  hypothetical protein  34.25 
 
 		 162 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4924  hypothetical protein  34.25 
 
 		 162 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5416  hypothetical protein  34.25 
 
 		 162 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5334  hypothetical protein  34.25 
 
 		 162 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000230397 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4939  group-specific protein  34.25 
 
 		 162 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0701218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 		 680 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  22.54 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3957  hypothetical protein  36.54 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  22.58 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5485  hypothetical protein  34.25 
 
 		 162 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3945  hypothetical protein  43.64 
 
 		 132 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5893  hypothetical protein  52.63 
 
 		 221 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0148  hypothetical protein  43.64 
 
 		 137 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608711  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3039  hypothetical protein  43.64 
 
 		 137 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4018  hypothetical protein  43.64 
 
 		 137 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  40.35 
 
 		 158 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3332  hypothetical protein  43.64 
 
 		 137 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1562  hypothetical protein  43.64 
 
 		 137 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06650  hypothetical protein  39.44 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.427339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  26.15 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>