68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2261 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  93.22 
 
 
369 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  98.91 
 
 
369 aa  741    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  100 
 
 
369 aa  749    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  72.53 
 
 
376 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  70.88 
 
 
376 aa  511  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  67.98 
 
 
396 aa  500  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  65 
 
 
369 aa  465  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  49.59 
 
 
370 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  50.14 
 
 
375 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  53.12 
 
 
363 aa  340  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  47.55 
 
 
368 aa  337  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  44.7 
 
 
387 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  46.24 
 
 
360 aa  315  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  46.35 
 
 
344 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  47.67 
 
 
340 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  45.77 
 
 
337 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  44.64 
 
 
371 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  40 
 
 
380 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  47.43 
 
 
353 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  45.15 
 
 
355 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  47.83 
 
 
371 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  46.9 
 
 
353 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  46.9 
 
 
356 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  46.9 
 
 
346 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  45.74 
 
 
350 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  46.51 
 
 
346 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  46.51 
 
 
346 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  44.6 
 
 
349 aa  255  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  45.63 
 
 
342 aa  255  9e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  46.25 
 
 
346 aa  247  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  42.46 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  41.27 
 
 
349 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.83 
 
 
388 aa  229  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  41.27 
 
 
349 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.43 
 
 
317 aa  222  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  42.32 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  40.98 
 
 
353 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.72 
 
 
315 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.29 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.59 
 
 
360 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  35.86 
 
 
370 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  34.93 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  28.62 
 
 
330 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  26.98 
 
 
334 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  32.78 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  28.91 
 
 
433 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  31.89 
 
 
406 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  28.51 
 
 
351 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  30.23 
 
 
325 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  28.4 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  26.23 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  29.07 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  28.4 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  28.02 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  25 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  24.9 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  23.81 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  20.66 
 
 
397 aa  57.4  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  20.4 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0296  hypothetical protein  40.32 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542313  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  22.42 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3370  band 7 protein  23.11 
 
 
306 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  37.1 
 
 
409 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2221  band 7 protein  21.21 
 
 
310 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.814731  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1651  hypothetical protein  36.07 
 
 
187 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0756  hypothetical protein  32.81 
 
 
178 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2765  band 7 protein  20.56 
 
 
288 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  31.82 
 
 
576 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>