69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4271 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  100 
 
 		 356 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  97.47 
 
 		 353 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  90.45 
 
 		 346 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  90.45 
 
 		 346 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  90.73 
 
 		 346 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  84.55 
 
 		 350 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  65.54 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  65.54 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  61.97 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  55.21 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  59.15 
 
 		 349 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  59.15 
 
 		 349 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  52.62 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  53.59 
 
 		 349 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  51.64 
 
 		 353 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  51.64 
 
 		 371 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  59.38 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  53.61 
 
 		 346 aa  344  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  46.83 
 
 		 369 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  46.83 
 
 		 369 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  46.43 
 
 		 369 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  46.15 
 
 		 376 aa  258  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  43.63 
 
 		 369 aa  256  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.32 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.14 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  47.1 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  45.17 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  44.27 
 
 		 363 aa  242  9e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  41.29 
 
 		 387 aa  228  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  38.38 
 
 		 371 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  38.54 
 
 		 360 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.42 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.75 
 
 		 317 aa  213  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.01 
 
 		 315 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  39.85 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  36.36 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  36.11 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  35.32 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.8 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  31.29 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.97 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  30.68 
 
 		 370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  29.25 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  22.67 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  25.85 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  25.55 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  28.4 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  21.92 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  28.29 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  29.77 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  30.85 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  31.37 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  30.88 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  28.09 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  23.48 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.17 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  24.24 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  25.51 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  25.55 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03651  hypothetical protein  51.72 
 
 		 203 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  23.23 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  23.23 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0413  hypothetical protein  40.98 
 
 		 213 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  26.53 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  25.51 
 
 		 304 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  23.3 
 
 		 291 aa  42.7  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  25.27 
 
 		 332 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>