70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1383 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  100 
 
 
387 aa  782    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  64.99 
 
 
360 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  45.45 
 
 
370 aa  358  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  46.11 
 
 
368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  47.58 
 
 
375 aa  337  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  47.98 
 
 
363 aa  329  6e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  44.82 
 
 
369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  44.82 
 
 
369 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  43.52 
 
 
369 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  43.27 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  45.03 
 
 
396 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  40.05 
 
 
376 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  46.83 
 
 
337 aa  273  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  38.05 
 
 
380 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  46.74 
 
 
376 aa  266  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  44.76 
 
 
371 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  45.96 
 
 
344 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  43.3 
 
 
388 aa  246  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  45.74 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  46.25 
 
 
355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  46.64 
 
 
353 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  46.64 
 
 
371 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  46.64 
 
 
349 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  43.02 
 
 
349 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  43.02 
 
 
349 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.64 
 
 
317 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  40.48 
 
 
342 aa  229  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  42.25 
 
 
343 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.11 
 
 
315 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  41.15 
 
 
346 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  40.77 
 
 
353 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  40.77 
 
 
356 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.3 
 
 
356 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  40.77 
 
 
346 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  43.87 
 
 
346 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  40.77 
 
 
346 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  40.38 
 
 
350 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  35.73 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.93 
 
 
360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  38.35 
 
 
353 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  35.4 
 
 
376 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  31.47 
 
 
370 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  28.26 
 
 
334 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  29.45 
 
 
330 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  31.6 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  32.65 
 
 
406 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  26.47 
 
 
380 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  27.23 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  29.62 
 
 
325 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  31.15 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  31.15 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  31.42 
 
 
340 aa  92  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  31.15 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  29.29 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  24.28 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  24.92 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  24.91 
 
 
403 aa  61.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  23.04 
 
 
401 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  21.03 
 
 
291 aa  50.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2318  hypothetical protein  32.47 
 
 
276 aa  50.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  23.29 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  34.92 
 
 
409 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1336  hypothetical protein  32.81 
 
 
327 aa  47  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000287065  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2106  hypothetical protein  30.08 
 
 
379 aa  46.2  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0725633 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  27.27 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2765  band 7 protein  28.75 
 
 
288 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  21.73 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1033  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 
332 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0869  hypothetical protein  24.41 
 
 
392 aa  43.5  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1615  hypothetical protein  26.92 
 
 
413 aa  43.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>