22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2765 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2765  band 7 protein  100 
 
 
288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0822  band 7 protein  66.78 
 
 
292 aa  406  1.0000000000000001e-112  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  42.02 
 
 
291 aa  227  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2318  hypothetical protein  28.74 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1141  hypothetical protein  24.12 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  29.13 
 
 
325 aa  92.8  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  24.64 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  24.64 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  24.64 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  25.12 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.86 
 
 
388 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  23.18 
 
 
353 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  22.73 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  28.75 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  20.28 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  20.28 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  20.28 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  30.94 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  20.28 
 
 
369 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  21.28 
 
 
396 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  26.32 
 
 
375 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  20.72 
 
 
360 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>