11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0822 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0822  band 7 protein  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2765  band 7 protein  68.12 
 
 
288 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  40.08 
 
 
291 aa  217  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2318  hypothetical protein  29.01 
 
 
276 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1141  hypothetical protein  24.31 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  25.73 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  24.41 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  24.41 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  23.94 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  24.88 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.79 
 
 
370 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>