45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1399 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  598  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2765  band 7 protein  42.02 
 
 
288 aa  227  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0822  band 7 protein  40.08 
 
 
292 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2318  hypothetical protein  28.74 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1141  hypothetical protein  27.78 
 
 
292 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  25.57 
 
 
325 aa  87  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  27.27 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  26.48 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  26.88 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  26.48 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  23.15 
 
 
330 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  27.7 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  23.15 
 
 
396 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  22.44 
 
 
355 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  22.4 
 
 
376 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.22 
 
 
388 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  20.56 
 
 
376 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  20.4 
 
 
369 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  20.4 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.66 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  19.9 
 
 
369 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  22.44 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  21.95 
 
 
353 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  25 
 
 
387 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  23 
 
 
433 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  24.43 
 
 
370 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  23.2 
 
 
371 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  21.58 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  26.92 
 
 
380 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  21.81 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  22.44 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  29.76 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  21.35 
 
 
349 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.08 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  21.35 
 
 
349 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  22.48 
 
 
349 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  23.08 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  21.88 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  22.12 
 
 
376 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  21.46 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  25.55 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  21.11 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  20.45 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  26.89 
 
 
360 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  24.11 
 
 
342 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>