91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0645 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  785    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  58.67 
 
 
370 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  48.42 
 
 
358 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  46.57 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.62 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.24 
 
 
360 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  39.08 
 
 
370 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.05 
 
 
388 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  37.6 
 
 
363 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.2 
 
 
368 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.65 
 
 
375 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  35.2 
 
 
369 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  35.71 
 
 
376 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  31.88 
 
 
351 aa  186  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  29.47 
 
 
433 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  34.92 
 
 
387 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  32.48 
 
 
371 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  34.8 
 
 
376 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.98 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  35.39 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  31.95 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  35.39 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  35.6 
 
 
360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  34.8 
 
 
396 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  34.06 
 
 
380 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  31.33 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  32.51 
 
 
353 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  29.67 
 
 
406 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.71 
 
 
315 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  31.6 
 
 
346 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  31.6 
 
 
353 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  31.6 
 
 
356 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  31.45 
 
 
371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  31.2 
 
 
346 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.82 
 
 
317 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  31.2 
 
 
346 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  29.2 
 
 
337 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  32.14 
 
 
355 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  30 
 
 
350 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  31.29 
 
 
349 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  30.12 
 
 
343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  30.52 
 
 
349 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  30.52 
 
 
349 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  26.75 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  30.6 
 
 
346 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  25.48 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  26.99 
 
 
325 aa  125  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  25.68 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  26.67 
 
 
330 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  26.61 
 
 
340 aa  94  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  25.95 
 
 
330 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  24.93 
 
 
403 aa  90.1  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  25.18 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  27 
 
 
323 aa  86.7  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  27.06 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  25.78 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  35 
 
 
237 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  31.96 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  24.32 
 
 
406 aa  56.2  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2048  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.113885  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44 
 
 
1149 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  28.07 
 
 
514 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  40.82 
 
 
214 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  40.43 
 
 
110 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0586  hypothetical protein  37.5 
 
 
299 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06650  hypothetical protein  28.45 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735412  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  23.5 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  22.54 
 
 
291 aa  47.8  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  47.4  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2408  hypothetical protein  26.67 
 
 
178 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  23.81 
 
 
505 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 
1139 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1477  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0120  hypothetical protein  28.21 
 
 
85 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00000151216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  40.38 
 
 
91 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  29.2 
 
 
336 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0982  putative transcriptional regulator, CopG family  33.77 
 
 
246 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.01357  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  38.89 
 
 
1148 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  37.74 
 
 
1151 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4022  protein serine/threonine phosphatase  35.19 
 
 
642 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2942  hypothetical protein  38 
 
 
169 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  37.74 
 
 
1151 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4342  hypothetical protein  32.76 
 
 
420 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0527256  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  43.14 
 
 
101 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38 
 
 
1080 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  42.31 
 
 
131 aa  43.5  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4140  hypothetical protein  38.18 
 
 
408 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.23808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  37.25 
 
 
157 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2655  hypothetical protein  30 
 
 
170 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0831745  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  27.97 
 
 
301 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0687  hypothetical protein  41.79 
 
 
502 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>