15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4140 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4140  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  840    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.23808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1392  hypothetical protein  39.51 
 
 
413 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0748724  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1402  hypothetical protein  36.19 
 
 
419 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0903793  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1103  hypothetical protein  28.96 
 
 
408 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0564  hypothetical protein  27.49 
 
 
407 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  27.19 
 
 
374 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.884235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4487  hypothetical protein  35.85 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3872  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36 
 
 
1149 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3145  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5075  hypothetical protein  31.67 
 
 
352 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.5 
 
 
388 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  30.91 
 
 
352 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  38.18 
 
 
376 aa  43.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0461  hypothetical protein  27.35 
 
 
356 aa  43.1  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>