21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0315 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  718    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0461  hypothetical protein  83.24 
 
 
356 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5075  hypothetical protein  70.2 
 
 
352 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1870  hypothetical protein  67.36 
 
 
347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466846  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4487  hypothetical protein  71.97 
 
 
376 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3145  hypothetical protein  69.79 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3872  hypothetical protein  69.5 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  64.55 
 
 
374 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.884235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0769  hypothetical protein  52.65 
 
 
351 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3936  hypothetical protein  41.06 
 
 
350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  38.2 
 
 
360 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0973  hypothetical protein  39.44 
 
 
360 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2084  hypothetical protein  39.44 
 
 
360 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2140  hypothetical protein  39.72 
 
 
360 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0419324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2272  hypothetical protein  39.72 
 
 
360 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.143558  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3857  hypothetical protein  38.82 
 
 
356 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0212  hypothetical protein  38.18 
 
 
380 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157427  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5880  hypothetical protein  39.51 
 
 
356 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0647392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  43.14 
 
 
169 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
1105 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4140  hypothetical protein  24.62 
 
 
408 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.23808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>