22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5075 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5075  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  714    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  70.2 
 
 		 352 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1870  hypothetical protein  67.66 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3145  hypothetical protein  70.52 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3872  hypothetical protein  70.23 
 
 		 386 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0461  hypothetical protein  71.43 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4487  hypothetical protein  72.09 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  65.6 
 
 		 374 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0769  hypothetical protein  52.17 
 
 		 351 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3936  hypothetical protein  38.62 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  40.46 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2084  hypothetical protein  39.7 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0973  hypothetical protein  39.4 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2140  hypothetical protein  39.7 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0419324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2272  hypothetical protein  39.7 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.143558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0212  hypothetical protein  36.71 
 
 		 380 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3857  hypothetical protein  36.95 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5880  hypothetical protein  37.35 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0647392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1103  hypothetical protein  27.67 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4140  hypothetical protein  31.67 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.23808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  44.68 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2942  hypothetical protein  32.05 
 
 		 169 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.128852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>