19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3857 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5880  hypothetical protein  91.55 
 
 		 356 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0647392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0212  hypothetical protein  89.3 
 
 		 380 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3857  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  736    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  62.22 
 
 		 360 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0973  hypothetical protein  61.63 
 
 		 360 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2084  hypothetical protein  61.34 
 
 		 360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2272  hypothetical protein  61.92 
 
 		 360 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.143558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2140  hypothetical protein  61.92 
 
 		 360 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0419324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3936  hypothetical protein  40.79 
 
 		 350 aa  242  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  37.98 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1870  hypothetical protein  36.2 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3145  hypothetical protein  36.09 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3872  hypothetical protein  36.09 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4487  hypothetical protein  37.57 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0461  hypothetical protein  35.59 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5075  hypothetical protein  37.35 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  36.34 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0769  hypothetical protein  36.06 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1392  hypothetical protein  25 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0748724  normal  0.453102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>