19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5880 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5880  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  733    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0647392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0212  hypothetical protein  90.73 
 
 
380 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157427  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3857  hypothetical protein  91.55 
 
 
356 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  60.73 
 
 
360 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0973  hypothetical protein  59.71 
 
 
360 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2084  hypothetical protein  59.42 
 
 
360 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2272  hypothetical protein  60 
 
 
360 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.143558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2140  hypothetical protein  60 
 
 
360 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0419324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3936  hypothetical protein  40 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  38.41 
 
 
352 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1870  hypothetical protein  36.8 
 
 
347 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466846  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3145  hypothetical protein  37.8 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3872  hypothetical protein  37.18 
 
 
386 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0461  hypothetical protein  37.18 
 
 
356 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4487  hypothetical protein  37.14 
 
 
376 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5075  hypothetical protein  37.9 
 
 
352 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  36.49 
 
 
374 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.884235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0769  hypothetical protein  35.69 
 
 
351 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1392  hypothetical protein  25.76 
 
 
413 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0748724  normal  0.453102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>