22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2272 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2272  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  733    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.143558  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  93.61 
 
 
360 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2140  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  733    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0419324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0973  hypothetical protein  99.17 
 
 
360 aa  727    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2084  hypothetical protein  98.33 
 
 
360 aa  719    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3857  hypothetical protein  61.92 
 
 
356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0212  hypothetical protein  62.79 
 
 
380 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157427  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5880  hypothetical protein  60 
 
 
356 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0647392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3936  hypothetical protein  42.44 
 
 
350 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  39.43 
 
 
352 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1870  hypothetical protein  39.4 
 
 
347 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466846  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  39.66 
 
 
374 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.884235 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3872  hypothetical protein  41.92 
 
 
386 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3145  hypothetical protein  41.92 
 
 
386 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4487  hypothetical protein  41.67 
 
 
376 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5075  hypothetical protein  39.7 
 
 
352 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0461  hypothetical protein  38.67 
 
 
356 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0769  hypothetical protein  37.54 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1392  hypothetical protein  21.25 
 
 
413 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0748724  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.55 
 
 
1291 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.74 
 
 
1149 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  40.74 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>