20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3936 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3936  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  716    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  43.87 
 
 
360 aa  275  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0973  hypothetical protein  42.44 
 
 
360 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2084  hypothetical protein  42.15 
 
 
360 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2272  hypothetical protein  42.44 
 
 
360 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.143558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2140  hypothetical protein  42.44 
 
 
360 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0419324  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3857  hypothetical protein  40.79 
 
 
356 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0212  hypothetical protein  39.84 
 
 
380 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157427  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5880  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0647392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  41.06 
 
 
352 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1870  hypothetical protein  38.64 
 
 
347 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466846  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3872  hypothetical protein  37.72 
 
 
386 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3145  hypothetical protein  37.72 
 
 
386 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4487  hypothetical protein  39.65 
 
 
376 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0461  hypothetical protein  40.41 
 
 
356 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  37.1 
 
 
374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.884235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5075  hypothetical protein  38.62 
 
 
352 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0769  hypothetical protein  37.57 
 
 
351 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.96 
 
 
1149 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.62 
 
 
1089 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>