13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1103 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1103  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  842    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0564  hypothetical protein  55.06 
 
 
407 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1392  hypothetical protein  26.77 
 
 
413 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0748724  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4140  hypothetical protein  29.46 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.23808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1402  hypothetical protein  28.43 
 
 
419 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0903793  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.31 
 
 
1149 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  40.38 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  39.13 
 
 
323 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  39.58 
 
 
288 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  39.13 
 
 
330 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  40 
 
 
340 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  25.88 
 
 
110 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  39.13 
 
 
323 aa  43.1  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>