86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3771 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  100 
 
 		 433 aa  893    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  44.1 
 
 		 351 aa  306  6e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  35.34 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.44 
 
 		 356 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.27 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  30.18 
 
 		 376 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  32.51 
 
 		 358 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.06 
 
 		 388 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  31.69 
 
 		 353 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  28.26 
 
 		 370 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.45 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  28.2 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.05 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  31.23 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.08 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  29.34 
 
 		 363 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  31.6 
 
 		 387 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  31.3 
 
 		 344 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  29.89 
 
 		 369 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  27.6 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  29.71 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.33 
 
 		 317 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  27.72 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  30.72 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  29.18 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  29.18 
 
 		 369 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  29.17 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  27.38 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  30.36 
 
 		 340 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  26.64 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  31.1 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  26.52 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  29.36 
 
 		 346 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  29.31 
 
 		 346 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  29.31 
 
 		 346 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  25.51 
 
 		 325 aa  111  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  29.36 
 
 		 350 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  28.09 
 
 		 349 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  28.9 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  28.9 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  28.29 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  28.29 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  27.37 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  27.27 
 
 		 371 aa  106  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  27.98 
 
 		 346 aa  106  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  27.37 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  28.1 
 
 		 355 aa  103  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  23.78 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  25 
 
 		 397 aa  93.6  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  24.4 
 
 		 330 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  26.22 
 
 		 330 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  25.35 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  25.73 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  25.44 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  25.8 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  22.48 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  52 
 
 		 110 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1477  hypothetical protein  27.19 
 
 		 155 aa  53.5  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  37.5 
 
 		 237 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  23 
 
 		 291 aa  50.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  24.58 
 
 		 406 aa  50.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2318  hypothetical protein  31.17 
 
 		 276 aa  49.7  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0474  hypothetical protein  41.84 
 
 		 239 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  31.96 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.27 
 
 		 1141 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.75 
 
 		 1149 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  23.58 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  27.27 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  31.19 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0687  hypothetical protein  36.99 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06650  hypothetical protein  34 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1411  hypothetical protein  34.88 
 
 		 190 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  43.75 
 
 		 1139 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  28.71 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1346  hypothetical protein  32.31 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.427339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0574  hypothetical protein  32.56 
 
 		 190 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  37.31 
 
 		 288 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0667  hypothetical protein  38.1 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.747823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.92 
 
 		 1080 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  44.44 
 
 		 158 aa  44.3  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  45.83 
 
 		 1503 aa  43.9  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4395  hypothetical protein  28.57 
 
 		 93 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1521  FHA domain-containing protein  39.06 
 
 		 295 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111872  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5075  hypothetical protein  44.68 
 
 		 352 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0508  hypothetical protein  31.11 
 
 		 190 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>