66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3171 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  100 
 
 
397 aa  825    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  55.1 
 
 
403 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  56.02 
 
 
406 aa  442  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  31.03 
 
 
401 aa  209  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  30.33 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  30.7 
 
 
370 aa  142  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06420  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  28.88 
 
 
407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224562  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2106  hypothetical protein  27.86 
 
 
379 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0725633 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1615  hypothetical protein  27.9 
 
 
413 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  32.38 
 
 
372 aa  124  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0869  hypothetical protein  25.88 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  26.54 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  26.3 
 
 
334 aa  89.7  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  23.89 
 
 
358 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  21.8 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  24.49 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  25.18 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.9 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  23.64 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  24.34 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.87 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  20.41 
 
 
353 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  24.62 
 
 
344 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  22.55 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  24.8 
 
 
340 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  23.85 
 
 
330 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  23.86 
 
 
371 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  23.27 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  24.27 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  28.81 
 
 
363 aa  56.6  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.72 
 
 
370 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  25.38 
 
 
337 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  23.06 
 
 
406 aa  53.5  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  37.5 
 
 
288 aa  53.1  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  23.73 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  29.31 
 
 
317 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  23.39 
 
 
355 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  34.55 
 
 
376 aa  50.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  28.24 
 
 
360 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  23.75 
 
 
350 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  20.09 
 
 
376 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  27.12 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  22.33 
 
 
353 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  20.93 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  22.41 
 
 
343 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  22.33 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  22.79 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  21.76 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  21.76 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.3 
 
 
1149 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  22.52 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  26.72 
 
 
315 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  46.51 
 
 
131 aa  46.6  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  21.2 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  21.2 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2408  hypothetical protein  36.25 
 
 
178 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  45 
 
 
214 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 
1148 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09730  hypothetical protein  48.94 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.953034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 
1151 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  41.3 
 
 
1139 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 
1151 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  25.19 
 
 
330 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  21.83 
 
 
325 aa  43.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13900  hypothetical protein  63.64 
 
 
181 aa  43.1  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23540  hypothetical protein  56.52 
 
 
264 aa  42.7  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  hitchhiker  0.00287708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>