60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4151 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  795    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  26.29 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  29.89 
 
 
406 aa  123  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  27.3 
 
 
380 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.06 
 
 
356 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.59 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  28.02 
 
 
351 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  29.61 
 
 
358 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  26.42 
 
 
388 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  26.65 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  27.27 
 
 
353 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  27.37 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  26.91 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  27.61 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  25.5 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  28.35 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  29.44 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  24.53 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  29.13 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  29.52 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  27.31 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  28.77 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  27.61 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  27.31 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  28.13 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  27.83 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  27.83 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  36.59 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  27.04 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  24.63 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  26.6 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  27.31 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  24.35 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  24.63 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.69 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  23.5 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  25.36 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  26.32 
 
 
355 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  20.76 
 
 
317 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  25.36 
 
 
344 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  26.42 
 
 
346 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  23.6 
 
 
330 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.59 
 
 
397 aa  60.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  24.74 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  24.74 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  25.16 
 
 
406 aa  57  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  29.6 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  26.51 
 
 
349 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  29.6 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  29.6 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  29.6 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  29.6 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  24.14 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  24.36 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  28.8 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0687  hypothetical protein  46.3 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  26.4 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  27.2 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  26.4 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  39.47 
 
 
505 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>