82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5395 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  99.71 
 
 		 346 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  99.71 
 
 		 346 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  100 
 
 		 346 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  89.33 
 
 		 356 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  89.52 
 
 		 353 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  86 
 
 		 350 aa  554  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  66.28 
 
 		 344 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  66.57 
 
 		 340 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  62.03 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  56.81 
 
 		 337 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  60.23 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  60.23 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  55.17 
 
 		 349 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  52.56 
 
 		 353 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  52.56 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  53.95 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  60.14 
 
 		 342 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  54.57 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  46.83 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  46.83 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  46.15 
 
 		 376 aa  259  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  46.43 
 
 		 369 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  44.02 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.66 
 
 		 370 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.48 
 
 		 368 aa  255  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  45.61 
 
 		 396 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  45.56 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  44.66 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  41.67 
 
 		 387 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  38.73 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.73 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.03 
 
 		 315 aa  219  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  38.93 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.85 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  39.46 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  37.38 
 
 		 380 aa  195  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  36.46 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  31.46 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  35.32 
 
 		 353 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.25 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.62 
 
 		 360 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  30.68 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  29.76 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  23 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  27.05 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  25.55 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  27.27 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  24.04 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  28.68 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  29.32 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  29.39 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  28.19 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  31.37 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  30.88 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  22.42 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.26 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  25.25 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03651  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  49.3  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  24.24 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  26.53 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  24.24 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  21.2 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  27.55 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  26.53 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  26.37 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  25.51 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  26.53 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  25.28 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  26.53 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.53 
 
 		 305 aa  43.5  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.49 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  25.51 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  25.51 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  25.51 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  25.51 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.51 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  25.51 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.51 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  25.51 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  25.51 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>