77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3449 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  98.58 
 
 		 371 aa  702    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  100 
 
 		 353 aa  711    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  85.75 
 
 		 355 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  82.44 
 
 		 349 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  79.89 
 
 		 346 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  61.36 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  58.03 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  56.94 
 
 		 340 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  55.97 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  55.65 
 
 		 349 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  55.65 
 
 		 349 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  62.2 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  53.11 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  52.68 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  51.42 
 
 		 346 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  51.14 
 
 		 346 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  51.14 
 
 		 346 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  51.42 
 
 		 350 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  46.9 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  47.43 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  47.43 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  46.25 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  45.63 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  47.43 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  45.85 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  46.77 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.5 
 
 		 368 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  45.8 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.96 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  39.86 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  44.66 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  43.7 
 
 		 375 aa  222  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.84 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.26 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.86 
 
 		 315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  36.65 
 
 		 380 aa  198  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.93 
 
 		 356 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  35.43 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.71 
 
 		 360 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  36.74 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  30.4 
 
 		 370 aa  142  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  25.34 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  27.17 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  26.09 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  26.53 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  27.98 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  27.2 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  30.38 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  27.51 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  26.87 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  26.77 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  26.12 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  27.27 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  24.74 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  22.42 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  24.56 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  25.37 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  23.76 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  51.02 
 
 		 263 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.53 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  49.06 
 
 		 267 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  52.94 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  28.36 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  22.02 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2765  band 7 protein  23.25 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03651  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  58.82 
 
 		 226 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  49.06 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  48.89 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  51.43 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  54.29 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  52.5 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  36.23 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  55.88 
 
 		 263 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1021  hypothetical protein  33.82 
 
 		 121 aa  44.3  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  47.06 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>