108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1422 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  100 
 
 
380 aa  779    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  35.16 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  36.67 
 
 
351 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  27.34 
 
 
356 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.73 
 
 
388 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  30.35 
 
 
358 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  28.01 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  28.92 
 
 
353 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  26.39 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.6 
 
 
370 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  27.22 
 
 
370 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  32.4 
 
 
363 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  34.6 
 
 
376 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  29.63 
 
 
337 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  32.78 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  32.78 
 
 
369 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.95 
 
 
369 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  27.31 
 
 
375 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  28.23 
 
 
380 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  28.06 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  29.2 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  29.15 
 
 
371 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  26.95 
 
 
353 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  30.47 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  26.62 
 
 
371 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  30.08 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  27.73 
 
 
360 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  28.63 
 
 
344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  28.15 
 
 
368 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  28.57 
 
 
315 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  27.99 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  24.56 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  28.41 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  26.3 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  27.75 
 
 
340 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  26.54 
 
 
397 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  27.16 
 
 
346 aa  110  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  25.4 
 
 
403 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  27.05 
 
 
350 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  27.05 
 
 
356 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  27.05 
 
 
353 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  26.64 
 
 
317 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  27.05 
 
 
346 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  26.32 
 
 
349 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  26.32 
 
 
349 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  26.83 
 
 
346 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  26.83 
 
 
346 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  25.15 
 
 
325 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  24.29 
 
 
343 aa  96.7  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  24.35 
 
 
334 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  23.41 
 
 
330 aa  92.8  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  25.35 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  24.78 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  24.49 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  21.39 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  54.72 
 
 
131 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  49.02 
 
 
1291 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  23.81 
 
 
401 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  36.99 
 
 
680 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  39.39 
 
 
91 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  38.55 
 
 
237 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  47.92 
 
 
288 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  46.81 
 
 
110 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42 
 
 
1149 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  44 
 
 
158 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  37.74 
 
 
121 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  47.83 
 
 
624 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  38.46 
 
 
123 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2318  hypothetical protein  30.67 
 
 
276 aa  49.7  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  40.82 
 
 
1139 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  41.18 
 
 
101 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0525  hypothetical protein  27.93 
 
 
198 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.497399  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0167  hypothetical protein  38 
 
 
197 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  42 
 
 
1503 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  31.88 
 
 
123 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4022  protein serine/threonine phosphatase  43.75 
 
 
642 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  26.92 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 
1105 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  21.53 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  37.74 
 
 
100 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  37.74 
 
 
100 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2408  hypothetical protein  36 
 
 
178 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2825  hypothetical protein  42.55 
 
 
204 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  48.98 
 
 
406 aa  47  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.18 
 
 
1089 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.34 
 
 
1141 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
1151 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3332  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1562  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3039  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 
669 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 
669 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0148  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608711  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3289  hypothetical protein  45.83 
 
 
138 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3945  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4018  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0335  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5893  hypothetical protein  48.98 
 
 
221 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  29.25 
 
 
505 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>