71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1999 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  100 
 
 		 375 aa  761    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  49.2 
 
 		 370 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  49.87 
 
 		 369 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  49.6 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  47.47 
 
 		 380 aa  339  5.9999999999999996e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  49.07 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  47.42 
 
 		 387 aa  336  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  49.59 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  46.01 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  46.3 
 
 		 376 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  47.41 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  46.94 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  46.58 
 
 		 360 aa  308  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  45.5 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  45.77 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  42.59 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  43.48 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  42.29 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  42.47 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  42.47 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  42.61 
 
 		 353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  42.91 
 
 		 355 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  39.77 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  40.66 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  41.31 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  41.55 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  39.23 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  39.23 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  41.44 
 
 		 353 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  41.34 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  38.85 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  38.85 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  38.85 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.31 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  37.69 
 
 		 350 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  38.34 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  39.78 
 
 		 376 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  41.34 
 
 		 346 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  39.19 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.63 
 
 		 315 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.83 
 
 		 317 aa  189  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  36.4 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  29.66 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  27.83 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  30.04 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  34.98 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  27.31 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  31.71 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  31.07 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  25.29 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  25.68 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  24.06 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  27.31 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  25.58 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  29.32 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  27.27 
 
 		 323 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  29.41 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  23.66 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  27.57 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3438  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  23.4 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0756  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2318  hypothetical protein  34.21 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2106  hypothetical protein  24.36 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0725633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  37.7 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1615  hypothetical protein  22.64 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  22.91 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4511  hypothetical protein  35 
 
 		 727 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0869  hypothetical protein  25.95 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  25.37 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3371  Zinc finger-domain-containing protein  37.5 
 
 		 571 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>