41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1872 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  312  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  52.73 
 
 
353 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  36.79 
 
 
91 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  54 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  54 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  38.36 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3289  hypothetical protein  49.09 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  50 
 
 
131 aa  51.2  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  40.51 
 
 
406 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  41.07 
 
 
380 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  48.98 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3039  hypothetical protein  53.19 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  40.38 
 
 
370 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3332  hypothetical protein  53.19 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1562  hypothetical protein  53.19 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.68 
 
 
1149 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.55 
 
 
1089 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4018  hypothetical protein  53.19 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3945  hypothetical protein  53.19 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  38.18 
 
 
1503 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0148  hypothetical protein  53.19 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  39.44 
 
 
237 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.18 
 
 
388 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  42 
 
 
1148 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  46.94 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  36.92 
 
 
288 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  42.22 
 
 
1151 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  42.22 
 
 
1151 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  44.44 
 
 
433 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  39.62 
 
 
351 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  42.59 
 
 
100 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  41.3 
 
 
1093 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  42.59 
 
 
100 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  44.44 
 
 
1291 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  37.78 
 
 
1105 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  35.16 
 
 
358 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.33 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4395  hypothetical protein  32.41 
 
 
93 aa  40.8  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.78 
 
 
1141 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  44 
 
 
101 aa  40.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>