32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0115 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  85.83 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  71.65 
 
 		 123 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  75.19 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  73.08 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  73.08 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3289  hypothetical protein  55.38 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1562  hypothetical protein  65.38 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3039  hypothetical protein  65.38 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3332  hypothetical protein  65.38 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3945  hypothetical protein  65.38 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0148  hypothetical protein  65.38 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608711  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4018  hypothetical protein  65.38 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  35.16 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  46 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  42.31 
 
 		 406 aa  47.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  37.74 
 
 		 380 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  46.81 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 		 624 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  45.65 
 
 		 360 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  40.82 
 
 		 340 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  27.59 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  48.98 
 
 		 353 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  48 
 
 		 358 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  45.83 
 
 		 406 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  40.43 
 
 		 330 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.3 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  40.43 
 
 		 370 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0335  hypothetical protein  51.11 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4022  protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 		 642 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>