50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3305 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  235  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  77.17 
 
 
127 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  77.17 
 
 
127 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  76.8 
 
 
123 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  69.29 
 
 
127 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  72.13 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3289  hypothetical protein  43.66 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3039  hypothetical protein  57.69 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1562  hypothetical protein  57.69 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3332  hypothetical protein  57.69 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0148  hypothetical protein  55.93 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608711  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4018  hypothetical protein  55.93 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3945  hypothetical protein  55.93 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  48.94 
 
 
1093 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  36.92 
 
 
406 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  48 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  39.19 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  39.19 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  31.88 
 
 
380 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  38.3 
 
 
669 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  38.3 
 
 
669 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  29.79 
 
 
110 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  35.42 
 
 
624 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  39.66 
 
 
370 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3957  hypothetical protein  40 
 
 
421 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  50 
 
 
353 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  38 
 
 
1503 aa  45.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  43.75 
 
 
406 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 
1148 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  40.82 
 
 
340 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  42.37 
 
 
358 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  39.58 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  29.63 
 
 
356 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.58 
 
 
1149 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.3 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  34 
 
 
433 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  45.1 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4022  protein serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 
642 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6771  hypothetical protein  42.11 
 
 
457 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  40.43 
 
 
1151 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  31.37 
 
 
680 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  40.43 
 
 
330 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4342  hypothetical protein  36 
 
 
420 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0527256  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  60.71 
 
 
485 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  40.38 
 
 
325 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  38.46 
 
 
351 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  30.56 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  38.3 
 
 
288 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  38.3 
 
 
1151 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0335  hypothetical protein  48.89 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>