31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0335 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0335  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  41.38 
 
 		 406 aa  53.9  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.29 
 
 		 388 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  40.32 
 
 		 370 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  40.43 
 
 		 380 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.36 
 
 		 356 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  41.18 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 		 680 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  46.81 
 
 		 1093 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  45.65 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  40.79 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  45.65 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0139  hypothetical protein  52.17 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  40 
 
 		 352 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  35.09 
 
 		 330 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40 
 
 		 360 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0461  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  45.9 
 
 		 353 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  53.33 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  53.33 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  32.61 
 
 		 669 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  32.61 
 
 		 669 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  47.83 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0125  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  40 
 
 		 433 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  32 
 
 		 351 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  40.43 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  40 
 
 		 376 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>