15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0667 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0667  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  761    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.747823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 		 1148 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.26 
 
 		 1149 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  38.6 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 1151 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12980  hypothetical protein  22.06 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0496287  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  42.11 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1346  hypothetical protein  40 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.427339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.61 
 
 		 1089 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  38.1 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  33.9 
 
 		 110 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2374  hypothetical protein  27.69 
 
 		 498 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1597  primosomal protein N'  31.88 
 
 		 611 aa  43.9  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  42.37 
 
 		 1151 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1477  hypothetical protein  39.34 
 
 		 155 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>