More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1597 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1597  primosomal protein N'  100 
 
 
611 aa  1258    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0368  primosome assembly protein PriA  48.12 
 
 
614 aa  622  1e-177  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0472452  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1386  primosome assembly protein PriA  48.29 
 
 
611 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0321  primosome assembly protein PriA  49.76 
 
 
620 aa  605  1.0000000000000001e-171  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0862  primosome assembly protein PriA  48.61 
 
 
610 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0782  primosome assembly protein PriA  48.69 
 
 
617 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.489149  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0678  primosome assembly protein PriA  47.73 
 
 
616 aa  580  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158782  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1322  primosome assembly protein PriA  48.37 
 
 
617 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0707  primosome assembly protein PriA  48.53 
 
 
617 aa  571  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.270246  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1182  primosome assembly protein PriA  46.28 
 
 
614 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  33.97 
 
 
679 aa  324  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  34.42 
 
 
730 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  32.91 
 
 
660 aa  320  7e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  34.62 
 
 
801 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  34.25 
 
 
804 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  34.63 
 
 
801 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  34.63 
 
 
801 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  34.63 
 
 
801 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  34.63 
 
 
801 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  34.63 
 
 
801 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  34.63 
 
 
801 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  34.63 
 
 
801 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  34.63 
 
 
801 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0033  replication restart DNA helicase PriA  33.6 
 
 
666 aa  312  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.101123  normal  0.886692 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  34.68 
 
 
803 aa  312  1e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  34.56 
 
 
732 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  34.31 
 
 
802 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  34.31 
 
 
802 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  35.58 
 
 
749 aa  311  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  34.63 
 
 
801 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  34.58 
 
 
831 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  34.32 
 
 
751 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  35.27 
 
 
802 aa  310  6.999999999999999e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  35.07 
 
 
824 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  33.16 
 
 
813 aa  310  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  35.46 
 
 
745 aa  309  9e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  34.68 
 
 
803 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  33.83 
 
 
781 aa  308  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  35.98 
 
 
858 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  34.34 
 
 
752 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  33.85 
 
 
801 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  33.7 
 
 
715 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  34.06 
 
 
815 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  33.22 
 
 
752 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  34.17 
 
 
814 aa  303  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 
817 aa  303  9e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  32.98 
 
 
732 aa  302  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  33.78 
 
 
746 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  33.78 
 
 
804 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  32.63 
 
 
815 aa  300  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  31.76 
 
 
661 aa  299  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  35.98 
 
 
815 aa  298  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  32.45 
 
 
662 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  32.45 
 
 
662 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  35.37 
 
 
724 aa  298  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  33.33 
 
 
818 aa  297  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  32.94 
 
 
809 aa  296  7e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  33.79 
 
 
731 aa  296  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  33.59 
 
 
732 aa  296  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  34.71 
 
 
810 aa  296  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  32.01 
 
 
835 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  32.18 
 
 
775 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  34.87 
 
 
801 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  32.09 
 
 
732 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  36.34 
 
 
810 aa  293  6e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0169  primosome assembly protein PriA  33.2 
 
 
732 aa  293  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  32.75 
 
 
738 aa  293  8e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  31.93 
 
 
758 aa  293  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  33.46 
 
 
732 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  34.7 
 
 
812 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  34.38 
 
 
754 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  34.74 
 
 
832 aa  292  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  34.38 
 
 
815 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  33.77 
 
 
825 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  33.27 
 
 
843 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  35.4 
 
 
739 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  32.21 
 
 
731 aa  291  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  32.34 
 
 
768 aa  290  5.0000000000000004e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  34.95 
 
 
739 aa  290  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  31.61 
 
 
731 aa  290  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  31.14 
 
 
732 aa  290  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  31.14 
 
 
732 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03519  primosome assembly protein PriA  34.47 
 
 
729 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.822304  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  37.13 
 
 
815 aa  289  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  35.17 
 
 
724 aa  289  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  31.14 
 
 
732 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  33.08 
 
 
732 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  33.08 
 
 
732 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  33.47 
 
 
815 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  32.75 
 
 
732 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  34.35 
 
 
810 aa  288  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  31.48 
 
 
731 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  33.08 
 
 
732 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  32.75 
 
 
732 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  32.96 
 
 
815 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  34.24 
 
 
805 aa  288  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  33.08 
 
 
732 aa  287  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  33.08 
 
 
732 aa  287  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  33.08 
 
 
732 aa  287  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  31.49 
 
 
732 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>