More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1460 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  53.89 
 
 		 736 aa  737    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  55.82 
 
 		 738 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  54.56 
 
 		 725 aa  729    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  54.94 
 
 		 736 aa  780    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  55.89 
 
 		 744 aa  767    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  55.85 
 
 		 734 aa  777    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  53.06 
 
 		 727 aa  718    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  55.89 
 
 		 744 aa  767    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  54.48 
 
 		 754 aa  717    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  53.79 
 
 		 739 aa  754    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  52.18 
 
 		 730 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  55.39 
 
 		 729 aa  756    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  51.95 
 
 		 745 aa  731    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  55.65 
 
 		 727 aa  770    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  53.9 
 
 		 738 aa  748    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  52.39 
 
 		 734 aa  753    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  52.18 
 
 		 730 aa  703    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  52.29 
 
 		 730 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  54.56 
 
 		 759 aa  711    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  53.62 
 
 		 736 aa  757    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  54.22 
 
 		 725 aa  731    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  50.13 
 
 		 811 aa  676    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  55.42 
 
 		 735 aa  783    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  54.79 
 
 		 733 aa  770    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  51.73 
 
 		 732 aa  716    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  53.69 
 
 		 734 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  52.71 
 
 		 724 aa  687    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  55.65 
 
 		 735 aa  772    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  54.42 
 
 		 730 aa  719    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  53.41 
 
 		 738 aa  735    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  50.42 
 
 		 735 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  54.22 
 
 		 722 aa  733    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  56.96 
 
 		 726 aa  767    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  56.21 
 
 		 740 aa  775    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  56.23 
 
 		 738 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  51.11 
 
 		 727 aa  709    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 731 aa  1464    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  54.5 
 
 		 725 aa  738    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  50.41 
 
 		 744 aa  684    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  50.98 
 
 		 733 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  52.08 
 
 		 718 aa  592  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  37.08 
 
 		 658 aa  511  1e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  37.78 
 
 		 658 aa  507  9.999999999999999e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  34.56 
 
 		 780 aa  483  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  40.46 
 
 		 738 aa  480  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  37.01 
 
 		 758 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  35.9 
 
 		 709 aa  440  9.999999999999999e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  35 
 
 		 725 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  36.54 
 
 		 734 aa  435  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  35.27 
 
 		 733 aa  435  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  37.09 
 
 		 734 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  37.7 
 
 		 732 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  37.7 
 
 		 732 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.64 
 
 		 725 aa  429  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.64 
 
 		 725 aa  429  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  35.27 
 
 		 746 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  36.38 
 
 		 754 aa  429  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  37.98 
 
 		 732 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  41.86 
 
 		 752 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  35.54 
 
 		 731 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  37.7 
 
 		 732 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  37.57 
 
 		 732 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  35.32 
 
 		 733 aa  425  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  35.7 
 
 		 733 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  36.44 
 
 		 731 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  36.6 
 
 		 731 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  37.84 
 
 		 732 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  36.3 
 
 		 731 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  37.7 
 
 		 732 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  37.84 
 
 		 732 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0379  primosomal protein N'  36.13 
 
 		 731 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  37.42 
 
 		 739 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  37.84 
 
 		 732 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  35.22 
 
 		 731 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  36.78 
 
 		 743 aa  422  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  34.88 
 
 		 745 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  36.28 
 
 		 739 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  34.95 
 
 		 742 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  35.2 
 
 		 736 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  38.36 
 
 		 732 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  36.17 
 
 		 731 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  38.92 
 
 		 745 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  41.14 
 
 		 752 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  36.17 
 
 		 731 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3495  primosomal protein N'  36.06 
 
 		 736 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  36.06 
 
 		 736 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  37.53 
 
 		 739 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  36.28 
 
 		 739 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  38.08 
 
 		 739 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  39.59 
 
 		 815 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.86 
 
 		 801 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  37.15 
 
 		 739 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4426  primosomal protein N'  34.72 
 
 		 731 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0457  primosomal protein N'  36.33 
 
 		 736 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  39.93 
 
 		 804 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  36.86 
 
 		 801 aa  412  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.08 
 
 		 801 aa  412  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  34.21 
 
 		 753 aa  412  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  35.95 
 
 		 731 aa  412  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  36.38 
 
 		 739 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>