More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2053 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  57.59 
 
 		 744 aa  815    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  58.05 
 
 		 740 aa  827    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  59.81 
 
 		 725 aa  840    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  56.35 
 
 		 738 aa  815    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  61.74 
 
 		 754 aa  853    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  57.59 
 
 		 744 aa  814    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  60.49 
 
 		 725 aa  836    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  61.33 
 
 		 738 aa  860    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  50.96 
 
 		 730 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  51.19 
 
 		 734 aa  668    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 727 aa  1444    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  59.95 
 
 		 725 aa  843    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  60.57 
 
 		 730 aa  840    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  51.25 
 
 		 733 aa  656    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  51.78 
 
 		 745 aa  751    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  56.85 
 
 		 736 aa  803    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  50.14 
 
 		 724 aa  642    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  61.93 
 
 		 735 aa  886    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  51.61 
 
 		 733 aa  669    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  49.04 
 
 		 732 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  59.73 
 
 		 729 aa  828    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  61.27 
 
 		 734 aa  884    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  56.81 
 
 		 734 aa  808    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  62.04 
 
 		 735 aa  880    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  51.16 
 
 		 727 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  60.77 
 
 		 738 aa  853    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  56.49 
 
 		 738 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  50.97 
 
 		 722 aa  648    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  57.04 
 
 		 726 aa  783    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  55.65 
 
 		 731 aa  770    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  56.28 
 
 		 744 aa  780    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  61.93 
 
 		 736 aa  895    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  49.45 
 
 		 727 aa  639    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  61.29 
 
 		 736 aa  868    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  57.32 
 
 		 739 aa  793    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  51.91 
 
 		 759 aa  634  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  51.1 
 
 		 730 aa  635  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  51.1 
 
 		 730 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  48.9 
 
 		 735 aa  625  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  47.3 
 
 		 811 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  51.91 
 
 		 718 aa  578  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  34.5 
 
 		 780 aa  470  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  41.74 
 
 		 658 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  41.82 
 
 		 658 aa  465  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  40.95 
 
 		 738 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  39.13 
 
 		 752 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  34.52 
 
 		 709 aa  439  9.999999999999999e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  38.56 
 
 		 758 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  37 
 
 		 734 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  38.44 
 
 		 752 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  36.01 
 
 		 733 aa  435  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  38.52 
 
 		 754 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  38.97 
 
 		 739 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  38.92 
 
 		 739 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  38.31 
 
 		 746 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  38.92 
 
 		 739 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  38.73 
 
 		 746 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  36.22 
 
 		 733 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  34.9 
 
 		 733 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  38.21 
 
 		 739 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  38.32 
 
 		 744 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.62 
 
 		 774 aa  419  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  38.31 
 
 		 743 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  38.08 
 
 		 739 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  33.15 
 
 		 730 aa  413  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  38.09 
 
 		 732 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  43.29 
 
 		 858 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  37.12 
 
 		 744 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  38.86 
 
 		 733 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  37.92 
 
 		 739 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  38.87 
 
 		 804 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  32.44 
 
 		 732 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  34.58 
 
 		 745 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  39.13 
 
 		 739 aa  409  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  37.52 
 
 		 739 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  38.09 
 
 		 720 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  38.09 
 
 		 720 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  44.24 
 
 		 745 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.39 
 
 		 725 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  36.44 
 
 		 679 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0799  primosomal protein N'  38.78 
 
 		 774 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  40.41 
 
 		 724 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  43.31 
 
 		 751 aa  399  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  35.22 
 
 		 731 aa  398  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  35.28 
 
 		 731 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  35.15 
 
 		 731 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  35.28 
 
 		 731 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  35.15 
 
 		 731 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  43.65 
 
 		 814 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  35.57 
 
 		 732 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  35.57 
 
 		 732 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  35.86 
 
 		 732 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.12 
 
 		 725 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  35.57 
 
 		 732 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  38.3 
 
 		 730 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  40.22 
 
 		 662 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  40.15 
 
 		 662 aa  392  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  35.71 
 
 		 732 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  35.55 
 
 		 732 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  35.57 
 
 		 732 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>