More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1222 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  46.82 
 
 		 744 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  46.69 
 
 		 740 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 811 aa  1583    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  47.41 
 
 		 739 aa  656    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  47.76 
 
 		 733 aa  648    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  46.67 
 
 		 738 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  46.82 
 
 		 744 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  47.07 
 
 		 726 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  48.81 
 
 		 725 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  48.42 
 
 		 734 aa  662    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  48.68 
 
 		 725 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  52.24 
 
 		 759 aa  693    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  48.19 
 
 		 725 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  50.51 
 
 		 731 aa  722    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  46.48 
 
 		 734 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  46.42 
 
 		 738 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  47.64 
 
 		 736 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  47.26 
 
 		 738 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  47.3 
 
 		 727 aa  631  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  47.85 
 
 		 736 aa  628  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  47.97 
 
 		 722 aa  622  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  46.95 
 
 		 729 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  46.03 
 
 		 736 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  47.93 
 
 		 730 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  45.15 
 
 		 732 aa  609  1e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  46.16 
 
 		 735 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  46.21 
 
 		 738 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  47.1 
 
 		 730 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  47.1 
 
 		 730 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  47.77 
 
 		 754 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  47.54 
 
 		 730 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  45.51 
 
 		 727 aa  598  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  45.66 
 
 		 727 aa  595  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  42.91 
 
 		 745 aa  593  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  46.09 
 
 		 744 aa  594  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  46.27 
 
 		 724 aa  591  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  43.43 
 
 		 735 aa  589  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  51.07 
 
 		 718 aa  567  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  43.69 
 
 		 734 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  44.05 
 
 		 733 aa  545  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  43.32 
 
 		 735 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  38.57 
 
 		 739 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  37.82 
 
 		 746 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  37.62 
 
 		 739 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  38.15 
 
 		 739 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  38.15 
 
 		 739 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  37.9 
 
 		 739 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  38 
 
 		 739 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  37.38 
 
 		 739 aa  436  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  37.19 
 
 		 743 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  37.2 
 
 		 738 aa  432  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  37.13 
 
 		 744 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  38.86 
 
 		 739 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.57 
 
 		 774 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  34.25 
 
 		 733 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  35.54 
 
 		 758 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  35.59 
 
 		 732 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  37.34 
 
 		 720 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  35.91 
 
 		 731 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  37.34 
 
 		 720 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  34.37 
 
 		 731 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  34.37 
 
 		 731 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  34.37 
 
 		 731 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  34.37 
 
 		 731 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  34.79 
 
 		 734 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3495  primosomal protein N'  34.07 
 
 		 736 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0457  primosomal protein N'  34.2 
 
 		 736 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  31.63 
 
 		 745 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  34.2 
 
 		 736 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4122  primosomal protein N'  33.54 
 
 		 737 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  34.25 
 
 		 731 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  33.54 
 
 		 733 aa  406  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  32.87 
 
 		 733 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  35.38 
 
 		 732 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  35.38 
 
 		 732 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  35.05 
 
 		 732 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  35.06 
 
 		 754 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  35.68 
 
 		 723 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  36.39 
 
 		 733 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  35.82 
 
 		 732 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  35.5 
 
 		 732 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  32.65 
 
 		 658 aa  397  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  35.5 
 
 		 732 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  35.46 
 
 		 732 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  35.49 
 
 		 732 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  35.49 
 
 		 732 aa  395  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0799  primosomal protein N'  36.72 
 
 		 774 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  40.28 
 
 		 858 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  35.46 
 
 		 732 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  34.83 
 
 		 731 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0379  primosomal protein N'  33.96 
 
 		 731 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  35.49 
 
 		 732 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  34.87 
 
 		 746 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  34.67 
 
 		 732 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  35.46 
 
 		 732 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  35.17 
 
 		 731 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  38.95 
 
 		 738 aa  395  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  32.53 
 
 		 725 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  32.53 
 
 		 725 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0169  primosome assembly protein PriA  34.46 
 
 		 732 aa  392  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>